Военные отправляют в секретный комплекс отряд спецназа. К ним присоединяются Элис и полицейский Мэтт. У них есть всего три часа, чтобы остановить вирус.

Когда мужчина пришёл в сознание, он не смог вспомнить, кто он и что с ним произошло. Однако он мог говорить на нескольких языках и обладал другими необычными способностями.

Добравшись до банка в Цюрихе, мужчина обнаружил в своей ячейке крупную сумму денег, пистолет, адрес в Париже и несколько паспортов на разные имена, одно из которых — Джейсон Борн. Пытаясь восстановить своё прошлое, он попросил немецкую студентку Мари отвезти его в Париж. Тем временем ЦРУ уже вышло на след Борна.